虽然空位罚分显著地影响多序列比对,但是并不清楚当空位以不同的方法编码和使用不同的重建算法时系统发育分析结果是否存在差异。
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双序列比对是序列分析常用的方法之一,也是多序列比对和数据库搜索的基础。
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LSS-DCA: A Fast Multiple Sequence Alignment with Divide-and-conquer Algorithm
LSS-DCA:一个快速的分治多序列对齐算法
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探讨了多重序列比对和序列谱隐马尔可夫模型,讨论了隐马尔可夫模型的基本算法以及如何建立HMMs。
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隐马尔可夫模型(Hidden Markov model)用于多序列比对研究是生物信息学研究的新领域,其可以通过训练识别同一特征的蛋白质序列。
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